甘肅煤田地質局綜合普查隊下屬7個實體經營部門，分別是：地球物理勘查院、數碼測繪院、航測遙感院、地質勘查院、礦山環境與城市地質工程研究院、環境地質與災害防治工程院、天水華辰大酒店有限責任公司。

地球物理勘查院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊地球物理勘查院，具有國土資源部頒發的地球物理勘查甲級資質，主要從事煤田地震勘探、石油天然氣及工程地質勘查工作，集勘探和科研為一體，足跡遍及西北及山西、河北等十多個省市自治區，為國家勘探事業做出了貢獻。

數碼測繪院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊數碼測繪院，是集控制測量、工程測量、地籍測量、地形測量、航空攝影測量、房產測量、GPS測量及各類專業用圖編制和GIS地理信息工程等多種專業與技術手段為一體的甲級資質測繪單位。

航測遙感院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊航測遙感院是全國甲級測繪資質，主要開展航空攝影、攝影測量與遙感、地理信息系統工程、不動產測繪、控制測量、工程測量、地形測量、地下管線探測和地圖制圖等多種專業與技術手段為一體的綜合性測繪部門。

地質勘查院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊地質勘查院主要從事綜合固體礦產勘查及其延伸業活動。具有國土資源部頒發的固體、氣體礦產勘查乙級資質。負責地質勘查基金項目和基礎地質調查項目的論證、申報、設計和實施。在項目實施中積極推廣應用新技術、新方法，并承接開展工程地質、儲量核實、技術咨詢服務以及相關綜合研究等工作。

礦山環境與城市地質工程研究院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊礦山環境與城市地質工程研究院是我隊以甘肅省礦山環境與城市地質工程研究中心為平臺成立的，產學研密切結合的部門。部門技術人員全部為大學本科以上學歷，其中碩士研究生兩人;配備電多功能直流電法儀2臺套、瞬變電磁儀1臺套、管線探測儀2臺套地、質雷達1臺套。主要負責礦山環境調查評價及城市地質與地下空間調查評價的基礎理論和技術研究、電法勘探、采空區探測、城市地下管網調查及道路路基病害檢測等業務。

環境地質與災害防治工程院

　　甘肅煤田地質局綜合普查隊環境地質與災害防治工程院是開展地質勘查業務和承攬社會地質及延伸產業項目的綜合性部門，主要從事地質災害治理工程勘查、設計、施工，地質災害危險性評估，巖土工程勘察，生態修復工程的設計、施工，環保工程，環境治理，地基基礎工程，水文地質工程勘察等業務。

天水華辰大酒店有限責任公司

　　天水華辰大酒店是甘肅煤田地質局綜合普查隊按四星級標準興建的一家綜合性酒店。地處天水市岷山路繁華地段，地理位置優越，交通便利。